U.Yさんのように、将来的には退職することを前提として転職活動をされている方も少なくないと思います。ただ、企業の多くが、長期的に会社の戦力となってくれる人材を採用したいと考えています。正社員採用の場合は、特にその傾向が強いですね。
ですから、志望動機で将来独立を考えていることについて触れることは、控えておいた方が良いと思います。 将来の独立に役立つスキルや経験のために、入社を希望しているわけですから、その身につけたい経験やスキルをそのまま企業に志望動機としてアピールしてください。 「○○のスキルを身につけたいために、御社を志望しています。」と伝えていただければ、きっと真剣な気持ちが伝わるはずですよ。
将来の夢を叶えるためにも、まずは目前の転職活動を成功させてくださいね。